index - Génétique Microbienne et Environnement

Equipe GME, UMR MICALIS

L'équipe GME étudie les propriétés pathogènes et adaptatives des bactéries sporulées du groupe Bacillus cereus sensu lato, ainsi que de Clostridioides difficile. Pour atteindre nos objectifs, nous nous appuyons sur des approches de génétique moléculaire et de biochimie, combinées à de l'imagerie en cellule unique ainsi que sur l'utilisation du modèle d'infection polyvalent Galleria mellonella. De notre recherche fondamentale découlent des applications biotechnologiques dans les domaines de la santé humaine, de la sécurité alimentaire et de la protection des cultures qui constituent une part importante des activités de l'équipe.

Le groupe B. cereus sensu lato comprend des bactéries sporulantes taxonomiquement proches, capables de coloniser des hôtes aussi divers que les mammifères et les insectes. Nous étudions en particulier Bacillus thuringiensis (Bt), une espèce entomopathogène utilisée comme biopesticide en raison de la production de protéines insecticides Cry, et B. cereus sensu stricto (Bc), une espèce responsable d'intoxications alimentaires chez l'humain. La capacité de ces bactéries à former des biofilms et des spores très adhérentes, largement distribuées dans l'environnement, entraîne une contamination récurrente des denrées alimentaires et des équipements utilisés par l'industrie agroalimentaire. Ces bactéries sont également des pathogènes opportunistes qui peuvent provoquer des infections nosocomiales locales ou systémiques (endocardite, pneumonie, septicémie, endophtalmie). Dans le cadre de l'utilisation des insectes comme nouvelle source d'alimentation humaine et animale, la santé des insectes et la sécurité microbienne ont été étudiées en mettant l'accent sur l'impact de Bt et Bc ainsi que de la prévention des infections.

Clostridioides difficile (Cd) est un entéro-pathogène anaérobie et sporulant, capable de passer d'une espèce hôte à une autre et représentant un problème de santé publique. Ce comportement opportuniste est contrôlé par le microbiote de l'hôte : il peut être éliminé ou porté de manière asymptomatique chez un hôte sain, mais, après un traitement antibiotique, la dysbiose du microbiote favorise l'émergence de Cd en tant qu'agent pathogène. Ses toxines sécrétées provoquent des diarrhées difficiles à traiter et récurrentes. Comme ceux de nombreux pathogènes, les biofilms de Cd pourraient être impliqués dans l'anti-tolérance, la persistance et la récurrence de l'infection.

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